中共南充市纪委南充市监委组织机构包括：内设职能部门、机关党委、直属单位和派驻纪检监察组。

内设职能部门：办公室、组织部、宣传部、政策法规研究室、党风政风监督室、信访室、案件监督管理室（信息技术保障室）、第一至第十纪检监察室、案件审理室、纪检监察干部监督室。

机关党委。

直属单位：市纪检监察教育中心（市监察委员会留置中心）、市纪检监察网络政务与电教中心。